Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Hoxb1P17919 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Hoxb1P17919 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Hoxb1P17919 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Hoxb1P17919 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Hoxb1P17919 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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