Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrphP15331 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrphP15331 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrphP15331 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrphP15331 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrphP15331 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrphP15331 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrphP15331 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrphP15331 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrphP15331 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrphP15331 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrphP15331 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrphP15331 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrphP15331 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrphP15331 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrphP15331 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrphP15331 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrphP15331 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrphP15331 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrphP15331 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrphP15331 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrphP15331 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrphP15331 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrphP15331 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrphP15331 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrphP15331 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrphP15331 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrphP15331 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrphP15331 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrphP15331 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrphP15331 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrphP15331 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrphP15331 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrphP15331 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrphP15331 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrphP15331 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrphP15331 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrphP15331 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrphP15331 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrphP15331 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrphP15331 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrphP15331 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrphP15331 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PrphP15331 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PrphP15331 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrphP15331 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrphP15331 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrphP15331 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrphP15331 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrphP15331 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrphP15331 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrphP15331 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrphP15331 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrphP15331 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrphP15331 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrphP15331 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrphP15331 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrphP15331 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrphP15331 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrphP15331 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrphP15331 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrphP15331 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrphP15331 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrphP15331 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrphP15331 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrphP15331 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PrphP15331 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrphP15331 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms