Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP11369 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP11369 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP11369 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP11369 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP11369 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP11369 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP11369 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP11369 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP11369 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP11369 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP11369 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP11369 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP11369 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP11369 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP11369 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP11369 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP11369 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP11369 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP11369 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP11369 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP11369 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP11369 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP11369 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP11369 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP11369 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP11369 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP11369 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP11369 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP11369 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP11369 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP11369 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP11369 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP11369 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP11369 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP11369 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP11369 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP11369 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP11369 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP11369 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP11369 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP11369 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP11369 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP11369 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP11369 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP11369 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP11369 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP11369 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP11369 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP11369 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP11369 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP11369 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP11369 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP11369 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolP11369 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolP11369 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolP11369 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolP11369 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolP11369 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolP11369 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolP11369 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolP11369 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolP11369 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolP11369 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolP11369 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolP11369 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolP11369 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolP11369 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolP11369 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolP11369 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PolP11369 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PolP11369 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PolP11369 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PolP11369 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PolP11369 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP11369 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms