Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prf1P10820 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prf1P10820 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms