Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd4P10628 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms