Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms