Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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