Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

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Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NefmP08553 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NefmP08553 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NefmP08553 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NefmP08553 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NefmP08553 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NefmP08553 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefmP08553 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefmP08553 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefmP08553 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefmP08553 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefmP08553 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefmP08553 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefmP08553 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefmP08553 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefmP08553 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefmP08553 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefmP08553 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefmP08553 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefmP08553 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefmP08553 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefmP08553 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefmP08553 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefmP08553 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefmP08553 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefmP08553 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefmP08553 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefmP08553 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefmP08553 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefmP08553 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NefmP08553 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NefmP08553 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NefmP08553 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NefmP08553 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NefmP08553 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NefmP08553 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NefmP08553 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NefmP08553 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NefmP08553 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NefmP08553 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NefmP08553 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NefmP08553 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NefmP08553 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NefmP08553 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NefmP08553 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NefmP08553 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NefmP08553 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NefmP08553 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NefmP08553 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NefmP08553 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NefmP08553 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NefmP08553 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NefmP08553 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NefmP08553 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NefmP08553 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NefmP08553 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NefmP08553 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NefmP08553 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NefmP08553 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NefmP08553 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NefmP08553 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NefmP08553 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NefmP08553 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NefmP08553 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NefmP08553 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NefmP08553 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NefmP08553 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NefmP08553 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NefmP08553 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NefmP08553 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NefmP08553 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NefmP08553 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefmP08553 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefmP08553 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefmP08553 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefmP08553 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefmP08553 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefmP08553 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefmP08553 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefmP08553 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefmP08553 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefmP08553 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefmP08553 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefmP08553 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefmP08553 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefmP08553 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefmP08553 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefmP08553 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefmP08553 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefmP08553 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NefmP08553 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefmP08553 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefmP08553 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefmP08553 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefmP08553 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefmP08553 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefmP08553 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NefmP08553 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NefmP08553 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NefmP08553 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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