Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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