Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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