Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnfP06804 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnfP06804 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnfP06804 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnfP06804 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnfP06804 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnfP06804 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TnfP06804 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnfP06804 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TnfP06804 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnfP06804 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TnfP06804 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TnfP06804 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnfP06804 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnfP06804 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnfP06804 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnfP06804 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnfP06804 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnfP06804 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnfP06804 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnfP06804 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnfP06804 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnfP06804 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnfP06804 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnfP06804 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TnfP06804 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TnfP06804 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TnfP06804 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TnfP06804 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms