Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa4P06798 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms