Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PdgfrbP05622 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PdgfrbP05622 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PdgfrbP05622 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PdgfrbP05622 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PdgfrbP05622 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PdgfrbP05622 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PdgfrbP05622 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PdgfrbP05622 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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