Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01740 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01740 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01740 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01740 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01740 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01740 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01740 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01740 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01740 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01740 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01740 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01740 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01740 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01740 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01740 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01740 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01740 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01740 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms