Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01672 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01672 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01672 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01672 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01672 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01672 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01672 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01672 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01672 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01672 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01672 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01672 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01672 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01672 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01672 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01672 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01672 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01672 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01672 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01672 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01672 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01672 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01672 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01672 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01672 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01672 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01672 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01672 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01672 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01672 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01672 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01672 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01672 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01672 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01672 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01672 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01672 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01672 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01672 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01672 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01672 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01672 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01672 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01672 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01672 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01672 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01672 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01672 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01672 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01672 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01672 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01672 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01672 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01672 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01672 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01672 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01672 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01672 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01672 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01672 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01672 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01672 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01672 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01672 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01672 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01672 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01672 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01672 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01672 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01672 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms