Protein–RNA interactions for Protein: P01670

Ig kappa chain V-III region PC 6684, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01670 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01670 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01670 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01670 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01670 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01670 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01670 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01670 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01670 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01670 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01670 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01670 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01670 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01670 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01670 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01670 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01670 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01670 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01670 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01670 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01670 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01670 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01670 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01670 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01670 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01670 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01670 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01670 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01670 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01670 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01670 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01670 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01670 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01670 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01670 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01670 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01670 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01670 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01670 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01670 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01670 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01670 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01670 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01670 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01670 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01670 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01670 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01670 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01670 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01670 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01670 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01670 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01670 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01670 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01670 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01670 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01670 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01670 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01670 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01670 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01670 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01670 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01670 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01670 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01670 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01670 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01670 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01670 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01670 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01670 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01670 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms