Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01653 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01653 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01653 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01653 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01653 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01653 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01653 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01653 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01653 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01653 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01653 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01653 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01653 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01653 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01653 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01653 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01653 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01653 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01653 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01653 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01653 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01653 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01653 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01653 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01653 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01653 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01653 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01653 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01653 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01653 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01653 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01653 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01653 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01653 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01653 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01653 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01653 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01653 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01653 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01653 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01653 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01653 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01653 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01653 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01653 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01653 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01653 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01653 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01653 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01653 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01653 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01653 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01653 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01653 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01653 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01653 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01653 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01653 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01653 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01653 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01653 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01653 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01653 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01653 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01653 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01653 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01653 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01653 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01653 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01653 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms