Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Casp8O89110 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms