Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3aO88508 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms