Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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CntfrO88507 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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CntfrO88507 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CntfrO88507 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms