Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns1O88456 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns1O88456 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns1O88456 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns1O88456 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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