Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AvilO88398 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AvilO88398 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AvilO88398 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AvilO88398 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AvilO88398 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AvilO88398 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AvilO88398 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AvilO88398 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AvilO88398 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AvilO88398 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AvilO88398 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AvilO88398 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AvilO88398 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AvilO88398 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AvilO88398 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AvilO88398 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AvilO88398 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AvilO88398 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AvilO88398 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AvilO88398 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AvilO88398 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AvilO88398 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AvilO88398 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AvilO88398 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AvilO88398 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AvilO88398 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AvilO88398 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AvilO88398 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AvilO88398 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AvilO88398 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AvilO88398 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AvilO88398 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AvilO88398 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AvilO88398 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AvilO88398 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AvilO88398 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AvilO88398 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AvilO88398 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AvilO88398 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AvilO88398 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AvilO88398 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AvilO88398 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AvilO88398 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AvilO88398 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AvilO88398 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AvilO88398 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AvilO88398 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AvilO88398 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AvilO88398 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AvilO88398 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AvilO88398 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms