Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ldb2O55203 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ldb2O55203 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ldb2O55203 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ldb2O55203 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ldb2O55203 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ldb2O55203 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ldb2O55203 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ldb2O55203 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ldb2O55203 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ldb2O55203 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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