Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms