Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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Cldn5O54942 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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Cldn5O54942 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Cldn5O54942 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Cldn5O54942 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Cldn5O54942 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Cldn5O54942 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Cldn5O54942 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Cldn5O54942 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Cldn5O54942 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Cldn5O54942 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Cldn5O54942 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Cldn5O54942 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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