Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TsksO54887 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TsksO54887 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TsksO54887 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TsksO54887 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TsksO54887 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TsksO54887 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TsksO54887 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TsksO54887 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TsksO54887 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TsksO54887 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TsksO54887 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TsksO54887 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TsksO54887 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TsksO54887 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TsksO54887 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TsksO54887 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TsksO54887 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TsksO54887 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TsksO54887 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TsksO54887 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TsksO54887 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TsksO54887 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TsksO54887 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TsksO54887 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TsksO54887 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TsksO54887 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TsksO54887 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TsksO54887 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TsksO54887 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TsksO54887 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TsksO54887 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TsksO54887 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TsksO54887 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TsksO54887 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TsksO54887 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TsksO54887 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TsksO54887 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TsksO54887 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TsksO54887 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TsksO54887 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TsksO54887 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TsksO54887 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TsksO54887 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TsksO54887 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TsksO54887 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TsksO54887 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TsksO54887 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TsksO54887 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TsksO54887 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TsksO54887 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TsksO54887 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TsksO54887 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TsksO54887 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TsksO54887 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TsksO54887 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TsksO54887 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TsksO54887 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TsksO54887 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TsksO54887 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TsksO54887 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TsksO54887 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TsksO54887 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TsksO54887 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TsksO54887 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TsksO54887 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TsksO54887 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TsksO54887 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TsksO54887 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TsksO54887 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms