Protein–RNA interactions for Protein: O54824

Il16, Pro-interleukin-16, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il16O54824 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Il16O54824 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Il16O54824 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Il16O54824 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Il16O54824 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Il16O54824 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Il16O54824 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Il16O54824 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il16O54824 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il16O54824 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il16O54824 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il16O54824 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il16O54824 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il16O54824 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il16O54824 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il16O54824 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il16O54824 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il16O54824 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il16O54824 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il16O54824 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il16O54824 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Il16O54824 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il16O54824 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il16O54824 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il16O54824 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il16O54824 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Il16O54824 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Il16O54824 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Il16O54824 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Il16O54824 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Il16O54824 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Il16O54824 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Il16O54824 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Il16O54824 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Il16O54824 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Il16O54824 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Il16O54824 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Il16O54824 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Il16O54824 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Il16O54824 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Il16O54824 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Il16O54824 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Il16O54824 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Il16O54824 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Il16O54824 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Il16O54824 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Il16O54824 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Il16O54824 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Il16O54824 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Il16O54824 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Il16O54824 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Il16O54824 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Il16O54824 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Il16O54824 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Il16O54824 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Il16O54824 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Il16O54824 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Il16O54824 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Il16O54824 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Il16O54824 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Il16O54824 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Il16O54824 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Il16O54824 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Il16O54824 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Il16O54824 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Il16O54824 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Il16O54824 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Il16O54824 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Il16O54824 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Il16O54824 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Il16O54824 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Il16O54824 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Il16O54824 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Il16O54824 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Il16O54824 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Il16O54824 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Il16O54824 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Il16O54824 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Il16O54824 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Il16O54824 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Il16O54824 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Il16O54824 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Il16O54824 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Il16O54824 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Il16O54824 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Il16O54824 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Il16O54824 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Il16O54824 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Il16O54824 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Il16O54824 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Il16O54824 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Il16O54824 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Il16O54824 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Il16O54824 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Il16O54824 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Il16O54824 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Il16O54824 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Il16O54824 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Il16O54824 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Il16O54824 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms