Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CrxO54751 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CrxO54751 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CrxO54751 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CrxO54751 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CrxO54751 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CrxO54751 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CrxO54751 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CrxO54751 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CrxO54751 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CrxO54751 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CrxO54751 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CrxO54751 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CrxO54751 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CrxO54751 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CrxO54751 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CrxO54751 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CrxO54751 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CrxO54751 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CrxO54751 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CrxO54751 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CrxO54751 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CrxO54751 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CrxO54751 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CrxO54751 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CrxO54751 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CrxO54751 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CrxO54751 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms