Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Sp100O35892 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Sp100O35892 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Sp100O35892 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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