Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf9O35739 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf9O35739 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf9O35739 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf9O35739 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Klf9O35739 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Klf9O35739 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Klf9O35739 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Klf9O35739 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Klf9O35739 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Klf9O35739 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Klf9O35739 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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