Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Tnfrsf18O35714 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Tnfrsf18O35714 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Tnfrsf18O35714 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Tnfrsf18O35714 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Tnfrsf18O35714 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Tnfrsf18O35714 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tnfrsf18O35714 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tnfrsf18O35714 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tnfrsf18O35714 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tnfrsf18O35714 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tnfrsf18O35714 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tnfrsf18O35714 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tnfrsf18O35714 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tnfrsf18O35714 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tnfrsf18O35714 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms