Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk2O35491 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Clk2O35491 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Clk2O35491 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Clk2O35491 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Clk2O35491 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Clk2O35491 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Clk2O35491 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk2O35491 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk2O35491 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Clk2O35491 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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