Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms