Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-ObO35424 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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