Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NmiO35309 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NmiO35309 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NmiO35309 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NmiO35309 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NmiO35309 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NmiO35309 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NmiO35309 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NmiO35309 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NmiO35309 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NmiO35309 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NmiO35309 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NmiO35309 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NmiO35309 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NmiO35309 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NmiO35309 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NmiO35309 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NmiO35309 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NmiO35309 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NmiO35309 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NmiO35309 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NmiO35309 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NmiO35309 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NmiO35309 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NmiO35309 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NmiO35309 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NmiO35309 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NmiO35309 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NmiO35309 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NmiO35309 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NmiO35309 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NmiO35309 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NmiO35309 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NmiO35309 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NmiO35309 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NmiO35309 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NmiO35309 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NmiO35309 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NmiO35309 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NmiO35309 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NmiO35309 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NmiO35309 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NmiO35309 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NmiO35309 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NmiO35309 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NmiO35309 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NmiO35309 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NmiO35309 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NmiO35309 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NmiO35309 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NmiO35309 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NmiO35309 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NmiO35309 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NmiO35309 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NmiO35309 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NmiO35309 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NmiO35309 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NmiO35309 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NmiO35309 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NmiO35309 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NmiO35309 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NmiO35309 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NmiO35309 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NmiO35309 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NmiO35309 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NmiO35309 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NmiO35309 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NmiO35309 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NmiO35309 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NmiO35309 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NmiO35309 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NmiO35309 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NmiO35309 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NmiO35309 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NmiO35309 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NmiO35309 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NmiO35309 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NmiO35309 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NmiO35309 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NmiO35309 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NmiO35309 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NmiO35309 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NmiO35309 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NmiO35309 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NmiO35309 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NmiO35309 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NmiO35309 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NmiO35309 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NmiO35309 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NmiO35309 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NmiO35309 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NmiO35309 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NmiO35309 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NmiO35309 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NmiO35309 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NmiO35309 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NmiO35309 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NmiO35309 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NmiO35309 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NmiO35309 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms