Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms