Protein–RNA interactions for Protein: O35214

Rrh, Visual pigment-like receptor peropsin, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RrhO35214 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RrhO35214 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RrhO35214 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RrhO35214 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RrhO35214 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RrhO35214 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RrhO35214 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RrhO35214 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RrhO35214 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RrhO35214 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RrhO35214 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RrhO35214 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RrhO35214 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RrhO35214 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RrhO35214 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RrhO35214 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RrhO35214 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RrhO35214 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RrhO35214 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RrhO35214 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RrhO35214 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RrhO35214 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RrhO35214 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RrhO35214 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RrhO35214 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RrhO35214 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RrhO35214 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms