Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Bhlhe40O35185 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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