Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1aO35134 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms