Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms