Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms