Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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