Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm2056J3QQ02 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms