Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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BC024978J3QPC3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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BC024978J3QPC3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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BC024978J3QPC3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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BC024978J3QPC3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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BC024978J3QPC3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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BC024978J3QPC3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BC024978J3QPC3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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BC024978J3QPC3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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BC024978J3QPC3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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BC024978J3QPC3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC024978J3QPC3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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BC024978J3QPC3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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