Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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