Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc180J3QNE4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms