Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Gm11236J3QMS7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Gm11236J3QMS7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Gm11236J3QMS7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Gm11236J3QMS7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Gm11236J3QMS7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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