Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn20G5E8X0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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