Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp17lcG5E8I7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp17lcG5E8I7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms