Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sclt1G5E861 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sclt1G5E861 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sclt1G5E861 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sclt1G5E861 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sclt1G5E861 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sclt1G5E861 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Sclt1G5E861 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Sclt1G5E861 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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